磷虾油凝胶糖果代加工的过程可以清晰地分为以下几个步骤，同时参考了相关文章中提到的信息：

磷虾油选择：选择高品质、磷脂含量高的南极磷虾油作为主要原料。

其他配料：准备微晶纤维素、山梨糖醇等辅助配料，以及明胶、甘油等用于制作胶皮的材料。

原料检验：对所有原料进行质量检验，确保符合生产标准。